仕於遼國

遼末招募遼東人為兵，號「怨軍」，以郭藥師為渠帥。斡魯古攻顯州，敗藥師于城下。耶律淳自立後，改「怨軍」為「常勝軍」，提拔藥師諸衞上將軍。耶律淳死後，其妻蕭妃稱制，郭藥師以涿州和易州歸宋。郭藥師以六千宋兵突然到達燕京，甄五臣以五千人奪迎春門。蕭妃令閉城門與宋兵巷戰，郭藥師大敗，丟掉了馬徒步逃跑，越城逃脫，仍獲宋人厚賞，後又作為功臣接受宋徽宗接見，說願意以死效勞。

張覺被殺

金太宗天會元年（1123年），宋燕山府宣撫使王安中為金朝所逼，殺以平州歸降的泰寧軍節度使、遼朝遺臣張覺。當時北宋對待原遼地漢人的政策非常不妥。張覺被殺時，在燕京的原遼降將及常勝軍皆哭，郭藥師作為其中一員，就說過：「若來索藥師當奈何？！」從此以後，這些降將降卒和北宋就不再是同心協力了。

降金侵宋

天會三年（1125年）八月，完顏宗望以張覺事變為由奏請攻宋。十月，金出兵伐宋。鎮守燕京的郭藥師，和完顏宗望一戰而敗後即投降，獲金太宗任為燕京留守，給金牌，賜姓完顏氏。郭藥師還成為滅宋先導，隨完顏宗望伐宋，最終導致「靖康之難」。郭藥師盡知宋朝虛實，完顏宗望能以孤軍深入，駐兵汴城下，約質納幣，割地全勝而還，郭藥師能測宋朝情形，是其中的關鍵。

郭藥師在第一次圍城之役充當嚮導，立下大功，完顏宗望卻很不信任他。回軍燕山後，宗望把常勝軍各級將佐數十人召來問道：「天祚待汝如何？」郭答：「天祚待我等厚。」又問：「趙皇如何？」郭答：「趙皇待我等尤厚。」完顏宗望忽然發怒，說：「天祚待汝厚，汝反天祚；趙皇待汝厚，汝反趙皇；我無金帛與汝等，汝定亦反我。」立刻命士兵把這些軍官棒殺。接著把常勝軍主力官兵八千餘人押往松亭關坑殺。留下郭藥師一人，名為燕京留守，實係拘留，後來貶死邊塞。

完顏亮即位後，詔令各賜姓者皆復本姓，故藥師子郭安國仍姓郭氏。

評價

• 金史/卷82：「郭藥師者，遼之餘孽，宋之厲階，金之功臣也。以一臣之身而為三國之禍福，如是其不侔也。魏公叔痤勸其君殺衛鞅，豈無所見歟！」